Toll样受体4基因AsP299G1Y多态性与肺炎链球菌病易感性的Meta分析(1)
[摘要]目的系统评价Toll样受体4(TLR4)基因Asp299Gly基因多态性与肺炎链球菌病易感性的相关性。方法计算机检索Pubmed，Cohrance，Embase，CNKI，维普，万方等网站，检索时限均为各数据库建库到2016年7月31日，搜尋符合纳入和排除条件的随机对照研究，采用RevMan5.3软件进行Meta分析及相关统计学分析。结果共纳入5篇文献，样本量总计为1456例，其中研究组501例，对照组955例。Meta分析未见TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病易感性相关(等位基因A vs G：OR=1.01，95%CI=0.49～2.07，P=0.98；基因型AA/AG vs GG：0R=0.67，95%CI=0.18～2.48，P=0.55；基因型AA vs AG/GG：OR=1.01，95%CI=0.47～2.19，P=0.98)。结论未见TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病易感性相关。
[关键词]TLR4基因Asp299Gly多态性；多态性；单核苷酸；肺炎链球菌病；Meta分析
[中图分类号]R446 [文献标识码]B [文章编号]2095-0616(2017)17-36-04
肺炎链球菌(streptococcus pneumoniae)是社区获得性肺炎的最常见的致病原因，在全球具有高发病率与死亡率。肺炎链球菌可导致局部感染如中耳炎和肺炎，亦可导致严重侵袭性疾病包括菌血症和脑膜炎，而后者是肺炎链球菌病导致5岁以下儿童死亡的主要病因。越来越多的研究表明，肺炎链球菌感染发展为侵入性致死性疾病与宿主遗传因素密切相关。Toll样受体(toll-like receptors，TLRs)基因是人体识别病原微生物并调控免疫反应的重要受体基因，参与介导和调控细菌和病毒的感染。Toll样受体基因中最重要的是TLR4基因，在急性炎症反应中发挥的作用尤为突出。TLR4基因3号外显子Asp299Glv突变推测与个体对肺炎链球菌病的易感性可能有关。TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病的相关性已有多篇文献报道，现搜集相关文献进行Meta分析，以期了解肺炎链球菌病易感性关系的基因证据。
1材料与方法
1.1文献检索方法
搜索Pubmed，Cohmnce，Embas数据库，英文检索词：Toll-like receptor、TLR、polymorphism、Streptococcuspneumoniae以及pneumococcal；系统地搜索CNKI、万方、知网等数据库，中文检索词：Toll样受体、TLR、肺炎链球菌病、肺炎。其搜索到的文章不需要限制语言的种类，有关TLR4基因多态性和肺炎链球菌病感染性关系的文章就可以收录。使用相应的手段找到更多的相关文献。全部的文章需要满足这样一个条件：在2016年7月31日之间发表的。
1.2文献标准
(1)TLR4基因多态性以及肺炎链球菌病感染情况有着一定的关系的病例对照文章；(2)研究信息完备，包括研究组以及对照组的每一个基因型分布情况；(3)论文中报道信息完整以及依照报道结果可以推算出每一个基因型分布情况，文中统计方式无错误；(4)清除未明确列出实验组或对照组基因型人数的文献；(5)对照人群不能偏离Hardy-Weinberg平衡(HWE)，P>0.05。
1.3质量评价
参考英国牛津循证医学中心文献严格评价项目(Oxford critical appraisal skill program，OxfordCASP，2004)㈣评价纳入病例对照研究的质量：(1)样本数目是不是足够多；(2)诊断标准是不是出现含糊不清的情况；(3)对照组是否和研究组有着比较性；(4)基因测定手段合理与否；(5)分组情况是否符合科学研究规定；(6)数据是否充分等。由第一作者与通信作者依据统一标准确定每篇文章是否纳入，假设意见不一致时可与其他作者讨论解决。
1.4统计学方法
Meta分析使用Review Manager5.3软件(Cochrane网下载)。每一项实验的差异性依照Cochrane手册。当试验结果出现显著异质性(I2>50%)时，使用随机效应模型，寻找异质性来源，并分析产生原因；当试验结果无明显异质性(I2≤50%)时，则使用固定效应模型。通过绘制倒漏斗图直观判断发表偏倚。
2结果
2.1文献筛选情况
总计纳入文献5篇，研究群体大部分为白人。总样本量1456例，研究组501例，对照组955例，纳入Meta分析的文献数据如表1。
2.2 Meta分析结果
2.2.1TLR4基因Asp299Gly位点等位基因与基因型结果 详见表2。
2.2.2等位基因模型(A vs G)Meta分析结果 等位基因A vs G时Q=8.35，P=0.08，F=52%，异质性大，采用随机效应模型得到OR=1.01(95%CI=0.49～2.07)，Z=0.03，P=0.98(图1)，差异无统计学意义，即TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病的关联无统计学意义。
2.2.3基因型模型(AA/AG vs GG)Meta分析结果 分析基因型AA/AG vs GG时：12=0%，采用固定效应模型得到OR=0.67(95%CI=0.18～2.48)，Z=0.60，P=0.55(图2)，即TLR4基因Asp299Glv多态性与肺炎链球菌病的关联无统计学意义。
2.2.4基因型模型(AA vs AG/GG)meta分析结果 基因型AA vs AG/GG时：12=53%，采用随机效应模型得OR=1.01(95%CI=0.47～2.19)，Z=0.03，P=0.98(图3)。均未见TLR4基因Asp299Glv多态性与肺炎链球菌病易感性存在相关性。漏斗图如图4所示，研究分布较为对称，表明发表偏倚尚可。, 百拇医药(朱满桂 冯艳 杜萌 刘星星 刘翠平 李夏西)
[关键词]TLR4基因Asp299Gly多态性；多态性；单核苷酸；肺炎链球菌病；Meta分析
[中图分类号]R446 [文献标识码]B [文章编号]2095-0616(2017)17-36-04
肺炎链球菌(streptococcus pneumoniae)是社区获得性肺炎的最常见的致病原因，在全球具有高发病率与死亡率。肺炎链球菌可导致局部感染如中耳炎和肺炎，亦可导致严重侵袭性疾病包括菌血症和脑膜炎，而后者是肺炎链球菌病导致5岁以下儿童死亡的主要病因。越来越多的研究表明，肺炎链球菌感染发展为侵入性致死性疾病与宿主遗传因素密切相关。Toll样受体(toll-like receptors，TLRs)基因是人体识别病原微生物并调控免疫反应的重要受体基因，参与介导和调控细菌和病毒的感染。Toll样受体基因中最重要的是TLR4基因，在急性炎症反应中发挥的作用尤为突出。TLR4基因3号外显子Asp299Glv突变推测与个体对肺炎链球菌病的易感性可能有关。TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病的相关性已有多篇文献报道，现搜集相关文献进行Meta分析，以期了解肺炎链球菌病易感性关系的基因证据。
1材料与方法
1.1文献检索方法
搜索Pubmed，Cohmnce，Embas数据库，英文检索词：Toll-like receptor、TLR、polymorphism、Streptococcuspneumoniae以及pneumococcal；系统地搜索CNKI、万方、知网等数据库，中文检索词：Toll样受体、TLR、肺炎链球菌病、肺炎。其搜索到的文章不需要限制语言的种类，有关TLR4基因多态性和肺炎链球菌病感染性关系的文章就可以收录。使用相应的手段找到更多的相关文献。全部的文章需要满足这样一个条件：在2016年7月31日之间发表的。
1.2文献标准
(1)TLR4基因多态性以及肺炎链球菌病感染情况有着一定的关系的病例对照文章；(2)研究信息完备，包括研究组以及对照组的每一个基因型分布情况；(3)论文中报道信息完整以及依照报道结果可以推算出每一个基因型分布情况，文中统计方式无错误；(4)清除未明确列出实验组或对照组基因型人数的文献；(5)对照人群不能偏离Hardy-Weinberg平衡(HWE)，P>0.05。
1.3质量评价
参考英国牛津循证医学中心文献严格评价项目(Oxford critical appraisal skill program，OxfordCASP，2004)㈣评价纳入病例对照研究的质量：(1)样本数目是不是足够多；(2)诊断标准是不是出现含糊不清的情况；(3)对照组是否和研究组有着比较性；(4)基因测定手段合理与否；(5)分组情况是否符合科学研究规定；(6)数据是否充分等。由第一作者与通信作者依据统一标准确定每篇文章是否纳入，假设意见不一致时可与其他作者讨论解决。
1.4统计学方法
Meta分析使用Review Manager5.3软件(Cochrane网下载)。每一项实验的差异性依照Cochrane手册。当试验结果出现显著异质性(I2>50%)时，使用随机效应模型，寻找异质性来源，并分析产生原因；当试验结果无明显异质性(I2≤50%)时，则使用固定效应模型。通过绘制倒漏斗图直观判断发表偏倚。
2结果
2.1文献筛选情况
总计纳入文献5篇，研究群体大部分为白人。总样本量1456例，研究组501例，对照组955例，纳入Meta分析的文献数据如表1。
2.2 Meta分析结果
2.2.1TLR4基因Asp299Gly位点等位基因与基因型结果 详见表2。
2.2.2等位基因模型(A vs G)Meta分析结果 等位基因A vs G时Q=8.35，P=0.08，F=52%，异质性大，采用随机效应模型得到OR=1.01(95%CI=0.49～2.07)，Z=0.03，P=0.98(图1)，差异无统计学意义，即TLR4基因Asp299Gly多态性与肺炎链球菌病的关联无统计学意义。
2.2.3基因型模型(AA/AG vs GG)Meta分析结果 分析基因型AA/AG vs GG时：12=0%，采用固定效应模型得到OR=0.67(95%CI=0.18～2.48)，Z=0.60，P=0.55(图2)，即TLR4基因Asp299Glv多态性与肺炎链球菌病的关联无统计学意义。
2.2.4基因型模型(AA vs AG/GG)meta分析结果 基因型AA vs AG/GG时：12=53%，采用随机效应模型得OR=1.01(95%CI=0.47～2.19)，Z=0.03，P=0.98(图3)。均未见TLR4基因Asp299Glv多态性与肺炎链球菌病易感性存在相关性。漏斗图如图4所示，研究分布较为对称，表明发表偏倚尚可。, 百拇医药(朱满桂 冯艳 杜萌 刘星星 刘翠平 李夏西)