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编号:11643148
SYBR green实时荧光定量PCR检测VEGF mRNA方法的建立(2)
http://www.100md.com 2008年7月1日 栾 琪 孙 静 孙林潮 李春英 高天文
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    参见附件(2295KB,3页)。

     1.2.3 标准曲线的绘制:根据标准品质粒pGEM-GAPDH、pIRES2-EGFP-VEGF定量结果和片断大小,查阅《分子克隆(第三版)》第1664页,得出质粒的拷贝浓度,后将其稀释为以下五个拷贝浓度(单位:拷贝/μl),分别为pGEM-GAPDH:108,107,106,105,104 拷贝/μl,pIRES2-EGFP-VEGF为107,106,105,104,103 拷贝/μl,作为mRNA 定量的标准品,以此绘制标准曲线。

    1.2.4 SYBR green 实时荧光定量PCR 检测VEGF mRNA 水平:实验分四组,分别为正常皮肤组、烧伤瘢痕组、A2058组和WM793组;反应体系为cDNA 模板1μl,上下游引物1μl,2×SYBR Premix EX Taq 10μl,水补至20μl;反应参数为95 ℃10s,57℃15s,72℃15s,荧光检测1次,共45个循环,从70 ℃至95℃,每0.4℃/s 为间隔绘制熔解曲线,反应结束后根据熔解曲线分析产物特异性。每组设3个复孔,即n=3。

    1.2.5 统计学分析:数据采用SPSS13.0统计软件进行分析,形式均采用x±s表示,数据处理应用单因素方差分析(ANOVA),P<0.05 表示有统计学差异。

    2结果

    2.1 GAPDH 和VEGF 的标准曲线:根据GAPDH 和VEGF 质粒DNA 定量结果,将其倍比稀释,行PCR后可见所得扩增曲线为典型的倒S形曲线,从左至右质粒DNA 浓度依次以10倍递减,且模板浓度越高,其循环阈值即Ct 越小,且五个样本基本处于一条直线,GAPDH 的相关系数r 为1,斜率为 -0.2869(图1-A),VEGF 的r 值为1,斜率为 -0.3064(图1-B),说明荧光定量PCR的质量控制较好,符合下步定量实验要求。

    2.2 PCR产物特异度分析:各组样本的VEGF荧光定量PCR 前,观察熔解曲线,以熔解曲线峰值的一致性,检测产物的特异度,也是结果是否准确可信的重要参考指标 ......

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