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编号:13171677
冷胁迫下铁皮石斛抗寒相关基因的SCoT差异表达分析(2)
http://www.100md.com 2013年2月15日 《中国中药杂志》 2013年第4期
     1.4.2cDNA第一链的SCoT PCR扩增PCR反应体系为10×buffer,2.0 μL;2.5 mmol·L-1 MgCl2,2.0 μL;0.1 mmol·L-1 dNTP 0.2 μL;0.5 μmol·L-1引物,1.0 μL;Taq DNA聚合酶,0.4 μL;第一链cDNA稀释产物3.0 μL;加水至20 μL。PCR反应程序为 94 ℃ 预变性5 min;94 ℃变性35 s,51 ℃退火35 s,72 ℃延伸1.5 min,共35个循环;72 ℃最后延伸10 min。PCR扩增产物在1.0% 的琼脂糖凝胶以120 V恒压电泳40 min。

    1.5差异片段的回收、克隆、测序与分析

    差异片段割胶用SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒回收纯化,溶于适量ddH2O,于-20 ℃保存备用。将回收的差异片段克隆到pGEM-T Easy vector载体上。连接产物转化大肠杆菌感受态细胞,在含有IPTG,X-gal,Amp抗性的培养基上37 ℃培养过夜,进行蓝白斑筛选,阳性克隆经菌液PCR检测后,于上海生工测序部测序。测序结果利用NCBI (http://ncbi.nlm.nih.gov) 数据库的BLAST分析功能比对测序结果。

    2结果与分析

    2.1RNA提取和逆转录

    提取的总RNA经电泳检测,28S,18S,5S带型完整且清晰,说明RNA的质量较好。紫外吸收值A260/A280的比在2.0~2.1,说明所提取的总RNA纯度较高,也说明该方法可以有效去除蛋白、多糖、酚类等物质的干扰(图1) ......
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